Physiopathologie
En ce qui concerne le système nerveux central et plus précisément le cerveau, la sérotonine appelée également cinq-hydroxytryptamine (5-HT) dérive d'un acide aminé qui est le tryptophane. Les neurones sérotoninergiques c'est-à-dire susceptibles de fabriquer de la sérotonine sont relativement peu nombreux, finalement à l'intérieur du cerveau. Mais ils semblent pourtant jouer un rôle primordial dans le fonctionnement du cerveau, essentiellement ce qui concerne l'humeur, l'émotivité ou encore le sommeil. C'est la raison pour laquelle, entre autres, au cours de la fibromyalgie les troubles du sommeil, les troubles de l'humeur, l'émotivité font orienter les recherches vers une dysrégulation des systèmes sérotoninergiques. Il en est de même pour certaines dépressions au sens sage du terme.